為鼓勵國內外化學相關領域的研究學者投稿學會期刊，每年由總編輯考量篩選與作業方式，於《會誌》與《化學》的完整年卷中拔擢傑出論文頒予年度最佳論文獎，學會將邀請得獎者出席該年度化學年會，並在年會頒獎典禮中公開表揚。
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2024 JCCS 《中國化學會會誌》年度最佳論文獎 歷年獎項得獎人名單
2024 Best Article Award in "JCCS " of the Chemical Society Located in Taipei
Guan-Bo Wang, Li-Ling Lin, Hsiang-Ting Wang, Hao Ming Chen*
J. Chin. Chem. Soc. 2023, 70, 2064–2088.
Arulmozhi Velusamy , Shuehlin Yau , Cheng-Liang Liu , Yamuna Ezhumalai , Prabakaran Kumaresan , Ming-Chou Chen*
J. Chin. Chem. Soc. 2023, 70, 2046–2063.
Rou-Jie Huang , Tiow-Gan Ong , Rong-Jie Chein*
J. Chin. Chem. Soc. 2023, 70, 2127–2135.